MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 4242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011984	GCA	2	6	128685	128690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2502	NC_011984	ATC	3	9	128709	128717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083249
2503	NC_011984	AAC	2	6	128761	128766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083249
2504	NC_011984	GAT	2	6	128768	128773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083249
2505	NC_011984	TCT	2	6	128801	128806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083249
2506	NC_011984	TGA	2	6	128822	128827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083249
2507	NC_011984	GT	3	6	128830	128835	0 %	50 %	50 %	0 %	222083249
2508	NC_011984	AGG	2	6	128860	128865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083249
2509	NC_011984	GAC	2	6	128904	128909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2510	NC_011984	CGA	2	6	128951	128956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2511	NC_011984	CCA	2	6	128986	128991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083249
2512	NC_011984	CG	3	6	129087	129092	0 %	0 %	50 %	50 %	222083249
2513	NC_011984	GCT	2	6	129155	129160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2514	NC_011984	GTG	2	6	129339	129344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083249
2515	NC_011984	GGA	2	6	129350	129355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083249
2516	NC_011984	AGC	2	6	129478	129483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2517	NC_011984	GAC	2	6	129507	129512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2518	NC_011984	TCA	2	6	129526	129531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083249
2519	NC_011984	GGA	2	6	129581	129586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083249
2520	NC_011984	ACA	2	6	129595	129600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083249
2521	NC_011984	TA	3	6	129660	129665	50 %	50 %	0 %	0 %	222083249
2522	NC_011984	GCC	2	6	129699	129704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083249
2523	NC_011984	GAT	2	6	129707	129712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083249
2524	NC_011984	CGA	2	6	129779	129784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2525	NC_011984	AGC	2	6	129853	129858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2526	NC_011984	TCG	2	6	129906	129911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2527	NC_011984	AGC	2	6	129997	130002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2528	NC_011984	CGTC	2	8	130016	130023	0 %	25 %	25 %	50 %	222083249
2529	NC_011984	TC	3	6	130074	130079	0 %	50 %	0 %	50 %	222083249
2530	NC_011984	AAC	2	6	130098	130103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083249
2531	NC_011984	GCC	2	6	130182	130187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083249
2532	NC_011984	CGA	2	6	130223	130228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2533	NC_011984	GCC	2	6	130287	130292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083249
2534	NC_011984	GAC	2	6	130299	130304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2535	NC_011984	CCG	2	6	130316	130321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083249
2536	NC_011984	CGG	2	6	130362	130367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083249
2537	NC_011984	AGG	2	6	130462	130467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083249
2538	NC_011984	TGA	2	6	130480	130485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083249
2539	NC_011984	CGG	2	6	130544	130549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083249
2540	NC_011984	ATTACC	2	12	130594	130605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083249
2541	NC_011984	GCT	2	6	130610	130615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2542	NC_011984	TC	3	6	130678	130683	0 %	50 %	0 %	50 %	222083249
2543	NC_011984	CCG	2	6	130751	130756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083249
2544	NC_011984	GTG	2	6	130786	130791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083249
2545	NC_011984	CGA	2	6	130805	130810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083249
2546	NC_011984	TGA	2	6	130871	130876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083249
2547	NC_011984	GCA	2	6	130904	130909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_011984	AGG	2	6	130946	130951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011984	CGC	2	6	130992	130997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_011984	TCT	2	6	131060	131065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083250
2551	NC_011984	CAG	2	6	131130	131135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083250
2552	NC_011984	GGTGGC	2	12	131164	131175	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222083250
2553	NC_011984	CGGTC	2	10	131349	131358	0 %	20 %	40 %	40 %	222083250
2554	NC_011984	CGC	2	6	131412	131417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083250
2555	NC_011984	TGC	2	6	131428	131433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083250
2556	NC_011984	CGC	2	6	131463	131468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083250
2557	NC_011984	CGC	2	6	131868	131873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083250
2558	NC_011984	A	8	8	131893	131900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_011984	GAT	2	6	131917	131922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011984	AGAAA	2	10	131958	131967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011984	AAG	2	6	131968	131973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011984	CGCTGT	2	12	132010	132021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_011984	CTC	2	6	132036	132041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_011984	TCCGC	2	10	132123	132132	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2565	NC_011984	GGAA	2	8	132151	132158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011984	CG	3	6	132243	132248	0 %	0 %	50 %	50 %	222083251
2567	NC_011984	GAC	2	6	132264	132269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2568	NC_011984	CAC	2	6	132289	132294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083251
2569	NC_011984	GCT	3	9	132305	132313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2570	NC_011984	CAT	2	6	132386	132391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083251
2571	NC_011984	GGCC	2	8	132395	132402	0 %	0 %	50 %	50 %	222083251
2572	NC_011984	CCG	2	6	132404	132409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2573	NC_011984	AGGC	2	8	132414	132421	25 %	0 %	50 %	25 %	222083251
2574	NC_011984	GGA	2	6	132437	132442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083251
2575	NC_011984	TCG	3	9	132454	132462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2576	NC_011984	GCG	2	6	132465	132470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2577	NC_011984	TGG	2	6	132496	132501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083251
2578	NC_011984	TCG	2	6	132559	132564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2579	NC_011984	TGC	2	6	132649	132654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2580	NC_011984	AGC	2	6	132697	132702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2581	NC_011984	CGC	3	9	132716	132724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2582	NC_011984	CTCG	2	8	132725	132732	0 %	25 %	25 %	50 %	222083251
2583	NC_011984	AGAA	2	8	132739	132746	75 %	0 %	25 %	0 %	222083251
2584	NC_011984	GAA	2	6	132767	132772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2585	NC_011984	TC	3	6	132799	132804	0 %	50 %	0 %	50 %	222083251
2586	NC_011984	GAT	2	6	132852	132857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
2587	NC_011984	CGCC	2	8	132901	132908	0 %	0 %	25 %	75 %	222083251
2588	NC_011984	AAC	2	6	132930	132935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2589	NC_011984	GC	3	6	132952	132957	0 %	0 %	50 %	50 %	222083251
2590	NC_011984	AAC	2	6	132975	132980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2591	NC_011984	AAG	2	6	132987	132992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2592	NC_011984	CAT	2	6	132998	133003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083251
2593	NC_011984	CAA	2	6	133010	133015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2594	NC_011984	GAA	2	6	133037	133042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2595	NC_011984	AAG	2	6	133149	133154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2596	NC_011984	ACG	2	6	133173	133178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2597	NC_011984	GCC	2	6	133182	133187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2598	NC_011984	TCG	2	6	133210	133215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2599	NC_011984	GTC	2	6	133236	133241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2600	NC_011984	GAC	2	6	133320	133325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2601	NC_011984	CGC	2	6	133427	133432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2602	NC_011984	GCTT	2	8	133457	133464	0 %	50 %	25 %	25 %	222083251
2603	NC_011984	CGG	2	6	133524	133529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2604	NC_011984	GTT	2	6	133548	133553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083251
2605	NC_011984	CTT	2	6	133589	133594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083251
2606	NC_011984	GGC	3	9	133649	133657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2607	NC_011984	TGC	2	6	133672	133677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2608	NC_011984	AGG	2	6	133726	133731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083251
2609	NC_011984	CGAG	2	8	133771	133778	25 %	0 %	50 %	25 %	222083251
2610	NC_011984	GGA	2	6	133832	133837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083251
2611	NC_011984	CCG	2	6	133855	133860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2612	NC_011984	TCGA	2	8	133861	133868	25 %	25 %	25 %	25 %	222083251
2613	NC_011984	GCGA	2	8	133875	133882	25 %	0 %	50 %	25 %	222083251
2614	NC_011984	TCCG	2	8	133898	133905	0 %	25 %	25 %	50 %	222083251
2615	NC_011984	GAT	2	6	133914	133919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
2616	NC_011984	CGA	2	6	133961	133966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2617	NC_011984	CGG	2	6	133987	133992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2618	NC_011984	CTC	2	6	134001	134006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_011984	GCC	3	9	134028	134036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2620	NC_011984	CGG	2	6	134052	134057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_011984	CCG	2	6	134120	134125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083252
2622	NC_011984	CTCA	2	8	134133	134140	25 %	25 %	0 %	50 %	222083252
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2624	NC_011984	TCG	2	6	134321	134326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083252
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2733	NC_011984	CG	3	6	138928	138933	0 %	0 %	50 %	50 %	222083257
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2740	NC_011984	CAGT	2	8	139559	139566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2743	NC_011984	GCA	2	6	139635	139640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2745	NC_011984	CTG	2	6	139693	139698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2747	NC_011984	GTG	2	6	139770	139775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2749	NC_011984	TGG	2	6	139814	139819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2989	NC_011984	CAGA	2	8	149834	149841	50 %	0 %	25 %	25 %	222083269
2990	NC_011984	TGATC	2	10	149907	149916	20 %	40 %	20 %	20 %	222083269
2991	NC_011984	GTGC	2	8	149923	149930	0 %	25 %	50 %	25 %	222083269
2992	NC_011984	GGC	2	6	149931	149936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083269
2993	NC_011984	TTC	2	6	149960	149965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083269
2994	NC_011984	ACCG	2	8	149991	149998	25 %	0 %	25 %	50 %	222083269
2995	NC_011984	GCA	2	6	150012	150017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083269
2996	NC_011984	TGGC	2	8	150047	150054	0 %	25 %	50 %	25 %	222083269
2997	NC_011984	GGT	2	6	150073	150078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083269
2998	NC_011984	CCGGTC	2	12	150142	150153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222083269
2999	NC_011984	GCG	3	9	150191	150199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083269
3000	NC_011984	CTT	2	6	150210	150215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083269

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